生菌数を測定するとどれくらいばらつくものなのですか？

同じ溶液や菌液の生菌数を測定した場合、結果が大きくばらつくことはほとんどありません。細かな条件によって変わりますが、せいぜい2倍前後です。
例えば、以下のようなイメージです。

測定結果（1回目）：1.8×10³ CFU/mL
測定結果（2回目）：1.1×10³ CFU/mL
測定結果（3回目）：3.3×10³ CFU/mL