試験の方法にもよりますが、例えば、下記のような菌種で試験が可能です。
謳いたい効果などにより、ご選択ください。
なお、グラム陽性菌、グラム陰性菌をそれぞれ少なくとも1種試験するというのが基本的な考え方ですので、最低限ということでしたら、例えば、黄色ブドウ球菌と大腸菌の試験を行っていれば、菌種の選び方としては妥当かと存じます。
・サルモネラ菌（Salmonella entericaなど）
・カンピロバクター（Campylobacter jejuniなど）
・黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus） ＊MRSA（メチシリン耐性黄色ブドウ球菌）でも試験可。
・大腸菌（Escherichia coli） ＊O157やO111でも試験可。
・ウェルシュ菌（Clostridium perfringens）
・腸炎ビブリオ（Vibrio parahaemolyticus）
・セレウス菌（Bacillus cereus）
・リステリア菌（Listeria monocytogenes）
・赤痢菌（Shigella sp.）