ある環境の微生物群集を遺伝子解析により、網羅的に解析するような菌叢解析は、弊社では実施しておりません。
検体をある条件で培養したときに検出される上位菌種（1～3種程度）を調べることは可能です。
あくまである培養条件で検出される菌種であること、上位菌種と下位菌種でおおむね数百倍の差があると、下位菌種は検出されないことには、注意が必要です。
【試験例】
細菌の検出によく用いられるソイビーン・カゼイン・ダイジェスト寒天培地に、検体を塗抹し、培養する。
培養して得られたコロニーの種類のうち、数が多いものをいくつか選び、同定して菌種を特定する。